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试管婴儿技术中有一项叫胚胎移植前诊断（PGD）的技术，俗称第三代试管婴儿，是可以做性别鉴定的。但这种技术仅限于有遗传性疾病，包括性连锁遗传性疾病的夫妇，为了优生，对他们精卵形成的胚胎，在放入子宫前，取出胚胎中的一个细胞进行基因和染色体检查。
如果遗传性疾病与性别有关，如血友病、男性发病、女性为携带者，女性不笨不发病，那就要进行胚胎的性别筛选，避免病儿出生。这项检查技术复杂，成本高。而且目前，用PGD技术可以检出的疾病很有限，所以要严格选择病例。
如果仅仅为了生男孩或女孩则完全没有必要做这项检查，而且国家政策也不允许。很多生殖机构多年的分娩资料显示，男性和女性的比例几乎是1∶1，所以试管婴儿技术决不能随意用来进行性别选择。
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